Nicolai giftet seg med Anna Meincke 22 Nov 1768. Anna (datter av Hilmar Meincke og Cathrine Möllmann) ble født 11 Apr 1743 , Trondheim, Sør-Trøndelag, Norway; ble døpt 19 Apr 1743 , Nidaros domkirke, Trondheim, Sør-Trøndelag, Norge; døde 30 Jan 1823, Munkvold, Trondheim, Sør-Trøndelag, Norge; ble begravet 12 Feb 1823, Nidaros domkirke, Trondheim, Sør-Trøndelag, Norge. [Gruppeskjema] [Familiediagram]

1. Katrine Sara Marie Krogh ble født 17 Aug 1769; ble døpt 27 Aug 1769 , Denmark; døde 19 Des 1772.
2. Christian Krogh ble født 10 Des 1771; døde cirka Nov 1801, Munkvold; ble begravet 22 Nov 1801, Domkirken.
3. Georgine Catharine Krogh ble født 18 Nov 1774 , Danmark; ble døpt 29 Nov 1774; døde 23 Aug 1819, Odense Municipality, Syddanmark, Denmark; ble begravet 27 Aug 1819, Sct Knud, Odense, Danmark.
4. Hilmar Meinche Krohg ble født 1 Jan 1776 , Trondheim, Sør-Trøndelag, Norway; døde 9 Aug 1851, Bolsøya; ble begravet 13 Aug 1851, Bolsøya.
5. Broder Lysholm Krohg ble født 19 Aug 1777; døde 16 Okt 1861.
6. Marta Marie Krogh ble født 20 Sep 1778; døde cirka 1801.
7. Stine Meincke Krogh ble født 1 Jul 1781 , Munkvold, Trondheim, Sør-Trøndelag, Norge; ble døpt 11 Jul 1781 , Nidaros domkirke, Trondheim, Sør-Trøndelag, Norge; døde 23 Okt 1841, Trondheim, Sør-Trøndelag, Norge; ble begravet 3 Nov 1841, Domkirken.
8. Theodor Kristian Krohg ble født 8 Jan 1783; døde cirka 1799.
9. Johan Bernt Krohg ble født 11 Sep 1786 , Trondheim, Sør-Trøndelag, Norge; ble døpt 29 Sep 1786 , Domkirken; døde 24 Nov 1855, Kragerø, Telemark, Norway; ble begravet 30 Nov 1855, Oslo, Norge.
10. Anna Nicoline Krohg ble født 19 Jun 1788; døde cirka 1841.