Morten giftet seg med Magdalene Cosmusdatter Bornemann 23 Aug 1693, Vor Frue Kirke, København. Magdalene (datter av Cosmus von Bornemann og Dorothea Olesdatter Worm) ble født cirka 1673; døde cirka Jul 1715; ble begravet 1 Aug 1715, Ifølge Ålborg Budolfi kirkebog opslag 154. [Gruppeskjema] [Familiediagram]

1. Morten Budolph ble født cirka 1693.
2. Kosmus Budolph ble født cirka 1694; døde 13 Jun 1712, Aalborg Bispegaard.