Frederik giftet seg med Albertine Cathrine de Benzon 4 Jun 1773, Nørre Tranders Sogn, Fleskum Herred, Aalborg Amt. Albertine (datter av Johannes Benzon og Fridericha Sophia de With) ble født 26 Feb 1751 , Nørre Tranders, Fleskum Herred, Aalborg Amt, Danmark; døde 20 Mar 1828, Overgaard Gods. [Gruppeskjema] [Familiediagram]

1. Ida Johanne Frederikke Arenstorff ble født cirka 1774.
2. Charlotte Christiane von Ahrenstorff ble født 15 Jun 1775; døde 15 Mar 1826, Viborg, Midtjylland, Danmark.
3. Fridrich von Ahrenstorff ble født 20 Aug 1777; døde 19 Mar 1844.
4. Frideriche Sophie von Ahrenstorff ble født 20 Aug 1777 , Overgaard; ble døpt 19 Okt 1777 , Udbyneder Sogn, Gjerlev Herred, Randers Amt; døde 11 Nov 1812.